65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0437 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  100 
 
 		 320 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  85.89 
 
 		 350 aa  531  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  75.76 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  76.98 
 
 		 312 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  75.6 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0394  penicillin-insensitive murein endopeptidase  68.97 
 
 		 320 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  66.46 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  65.85 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  64.36 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  66.32 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  64.81 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  65.4 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  63.99 
 
 		 309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  59.29 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  63.64 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  63.07 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  65.52 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3367  penicillin-insensitive murein endopeptidase  57.3 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1047  penicillin-insensitive murein endopeptidase  50.65 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0985  penicillin-insensitive murein endopeptidase  50.65 
 
 		 340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3596  penicillin-insensitive murein endopeptidase  55.3 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  52.73 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4445  penicillin-insensitive murein endopeptidase  58.44 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.710373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4131  penicillin-insensitive murein endopeptidase  58.87 
 
 		 358 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0461915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  52.16 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  49.45 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.76 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2663  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.08 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.52 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  48.36 
 
 		 293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0031  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 294 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1363  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 294 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.4 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1346  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.48 
 
 		 269 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2876  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.43 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0818548  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.75 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2592  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1515  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.8 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0376  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.8 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.02 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1406  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.8 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2810  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.71 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.32 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2485  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.43 
 
 		 274 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3469  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2480  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2706  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2623  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1324  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2572  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2625  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  hitchhiker  0.000000497544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2612  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2523  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2736  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.04 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.2 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1328  peptidase U6 penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.64 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02213  hypothetical protein  40.64 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02253  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.64 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  41.6 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.7 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.17 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6120  penicillin-insensitive murein endopeptidase  35.38 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6708  hypothetical protein  23.4 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.56 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  24.18 
 
 		 647 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>