18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3419 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  68.33 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  74 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  65.57 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  76.09 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  61.67 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  58 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  56.6 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  75 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  41.38 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  45.65 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0637  regulatory protein, FmdB family  38.57 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  32.14 
 
 		 128 aa  40  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2195  FmdB family regulatory protein  32.39 
 
 		 80 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>