45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2611 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2611  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.132011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6027  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.09 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.350512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0106  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  59.84 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4520  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  53.19 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1418  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.01 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0342  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2177  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.06 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148812  normal  0.0743485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0352  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26850  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  50.34 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.405147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0331  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  46.1 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5359  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.97 
 
 		 175 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0104  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.39 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07970  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  58.76 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131897  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1423  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2708  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.826826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2514  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.51 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2545  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.28 
 
 		 137 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2293  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.9 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2154  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.29 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119345  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.11 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.93 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  25.98 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.48 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.51 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  27.59 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.64 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.61 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.3 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.11 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.5 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.7 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1862  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.61 
 
 		 281 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.018097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  30.7 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.04 
 
 		 259 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0292  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  23.35 
 
 		 257 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>