15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1235 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  453  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  43.57 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  44.4 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  36.7 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  39.74 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  36.1 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  41.15 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  39.6 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  41.6 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  38 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  33.19 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  36.65 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  33.6 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  22.74 
 
 		 481 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>