18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4505 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  33.58 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  29.29 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  28.03 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  30.63 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  28.08 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  29.55 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  25.69 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  24.34 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  22.79 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  25.19 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  28.14 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  25.08 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  24.41 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  27.33 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  23.73 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  25.97 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  26.2 
 
 
372 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>