22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4427 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  907    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  40.68 
 
 
494 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  39.55 
 
 
498 aa  236  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5150  hypothetical protein  35.87 
 
 
634 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0397106  normal  0.0961186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4372  hypothetical protein  28.73 
 
 
424 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  45.45 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  32.33 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  33.72 
 
 
87 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  42.86 
 
 
307 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  34.52 
 
 
526 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  39.08 
 
 
87 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  34.15 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  36.21 
 
 
454 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  42.67 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  34.48 
 
 
87 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  34.48 
 
 
87 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  38.54 
 
 
527 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  36 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03140  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  34.88 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  35.79 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>