35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4000 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  74.27 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  69.32 
 
 		 290 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  73.44 
 
 		 272 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  73.03 
 
 		 272 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  73.44 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  73.44 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  73.44 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  73.53 
 
 		 288 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  72.24 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  63.98 
 
 		 284 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  72.2 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  64.44 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  72.27 
 
 		 272 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  63.33 
 
 		 275 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  52.42 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  52.94 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  51.91 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.42 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  27.11 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  48.33 
 
 		 91 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  44.62 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  46.55 
 
 		 85 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  29.03 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  25.68 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.73 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  24.53 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  25.85 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  41.38 
 
 		 106 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  29.15 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>