17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3978 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 237 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  59.26 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  28.4 
 
 		 120 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  52 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  43.66 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 341 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  38.89 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  50.94 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  32.5 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 849 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  36.84 
 
 		 116 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>