More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3120 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
307 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.67 
 
 
313 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.42 
 
 
309 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5582  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.93 
 
 
309 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4544  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 
323 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4637  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.55 
 
 
337 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
323 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
259 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 
262 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.35 
 
 
270 aa  92.4  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 
262 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  37.93 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 
253 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
262 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.6 
 
 
370 aa  89  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.47 
 
 
256 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  31.23 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  31.2 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.78 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  32.05 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
437 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  34.31 
 
 
261 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.62 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
262 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 
433 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.19 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
346 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  33.47 
 
 
261 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.17 
 
 
273 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.84 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.15 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.33 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  31.65 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  32.77 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.88 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  32.22 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  30.5 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.07 
 
 
249 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  33.05 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.77 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.41 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  33.04 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  33.48 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.62 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.92 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.29 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C55  ATPase for chromosome partitioning  26.01 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.51 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.74 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.84 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.47 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  32.74 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.89 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.65 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.61 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  35.08 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>