More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2573 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2573  Cysteine--tRNA ligase  100 
 
 
392 aa  781    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  hitchhiker  0.000587086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2219  Cysteine--tRNA ligase  65.47 
 
 
391 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0471843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  56.84 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1016  cysteine--tRNA ligase  59.44 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0427365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1446  cysteine--tRNA ligase  59.94 
 
 
373 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22970  cysteinyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
382 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299926  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0653  cysteine--tRNA ligase  51.5 
 
 
371 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
392 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  42.69 
 
 
372 aa  242  9e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
400 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
401 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
401 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  40.24 
 
 
407 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  40.18 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2628  cysteinyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
397 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
464 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  41 
 
 
414 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
429 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
403 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
455 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
484 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
484 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
457 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1544  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside ligase  40.48 
 
 
407 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.965113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
481 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
458 aa  211  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
458 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
456 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
454 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
444 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
494 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2091  cysteinyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
458 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22240  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
415 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0725298  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
458 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
498 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
480 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  40.12 
 
 
414 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
456 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
480 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
460 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
485 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
404 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
461 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
486 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
460 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
459 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
461 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
493 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
456 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
459 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
461 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
456 aa  203  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
463 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
461 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
460 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
465 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1983  cysteinyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
465 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746601  normal  0.57879 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  34.41 
 
 
497 aa  202  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2442  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  43.77 
 
 
413 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4502  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  38.9 
 
 
431 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1167  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
465 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103302  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
465 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
453 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5384  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
465 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.706062  normal  0.64461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.474792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
465 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
463 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
487 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
474 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
461 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1203  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
465 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0892832  normal  0.183053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2113  cysteinyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
465 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
459 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
460 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2201  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  37.33 
 
 
412 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0760868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>