More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1248 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1248  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
321 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0484421  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.23 
 
 
322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0297  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.91 
 
 
354 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0913  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  42 
 
 
331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0926548  decreased coverage  0.00569345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0906  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  41.5 
 
 
331 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0923  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  41.5 
 
 
331 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1217  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  39.5 
 
 
330 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  0.131023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.58 
 
 
322 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1754  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.71 
 
 
324 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.33 
 
 
330 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5126  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3718  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.11 
 
 
330 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0970  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.25 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.609858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.52 
 
 
322 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.11 
 
 
323 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.11 
 
 
323 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.53 
 
 
390 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.99 
 
 
326 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  25.97 
 
 
384 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.46 
 
 
325 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  27.68 
 
 
323 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.75 
 
 
322 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.6 
 
 
368 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  26.81 
 
 
322 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  28.08 
 
 
363 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.53 
 
 
375 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.99 
 
 
374 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.55 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.19 
 
 
323 aa  99.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.06 
 
 
436 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.67 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.93 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.09 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.67 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.67 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.21 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.78 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.01 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.76 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.83 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  28.04 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.46 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  25.23 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.85 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.04 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  27.55 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.55 
 
 
370 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.31 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.27 
 
 
322 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.47 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.09 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.32 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.33 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  25 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.43 
 
 
365 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  26.26 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.47 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.7 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3668  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.9 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.63 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.25 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  25.63 
 
 
372 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.04 
 
 
351 aa  89.4  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.18 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.1 
 
 
321 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.69 
 
 
352 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  27 
 
 
417 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.47 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.53 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.06 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.02 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  28.18 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.38 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.71 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.94 
 
 
353 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.74 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  24.92 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.74 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.74 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.88 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.95 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.41 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.69 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.13 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.32 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.39 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.7 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.96 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.17 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  25.48 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.64 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  26.15 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  27.78 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.16 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.03 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>