25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4611 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  100 
 
 
124 aa  256  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  77.42 
 
 
124 aa  208  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  37.84 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.68 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  35.59 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.59 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.59 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  31.25 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.89 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  34.45 
 
 
142 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.71 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  26.72 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  34.4 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.44 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  30.33 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0382  protein of unknown function DUF1486  27.87 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.410287  normal  0.616115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0339  hypothetical protein  26.19 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.33 
 
 
128 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0103  putative isomerase  31.15 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.759275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.09 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>