More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3894 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  90.51 
 
 
497 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  100 
 
 
498 aa  996    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  35.62 
 
 
510 aa  193  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12180  transposase  33.7 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 
517 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  32.91 
 
 
517 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7081  hypothetical protein  62.2 
 
 
334 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  28.94 
 
 
491 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  28.94 
 
 
340 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  29.26 
 
 
340 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  28.62 
 
 
491 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  28.62 
 
 
491 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  30.72 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  28.62 
 
 
489 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  28.94 
 
 
338 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  27.85 
 
 
340 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  28.62 
 
 
340 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  27.09 
 
 
340 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  27.09 
 
 
348 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  27.09 
 
 
348 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  28.5 
 
 
413 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  33.21 
 
 
449 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  33.21 
 
 
449 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.36 
 
 
410 aa  91.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  29.38 
 
 
518 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  29.38 
 
 
518 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  29.38 
 
 
518 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  29.38 
 
 
518 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  27.92 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  27.92 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  30.52 
 
 
340 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  29.04 
 
 
523 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2909  ISGsu6, transposase OrfA  28.43 
 
 
342 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.29922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3407  ISGsu6, transposase OrfA  28.43 
 
 
342 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  27.41 
 
 
341 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  27.41 
 
 
341 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>