37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3041 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  91.25 
 
 		 160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  42.07 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  38.61 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  40.45 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  37.72 
 
 		 185 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  35.97 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.08 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  28.76 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.74 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.53 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.78 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.28 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  27.16 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  26.21 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  22.76 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  24.22 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.96 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  24.22 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  24.8 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.18 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.21 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  27.21 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  27.21 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  26.67 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.58 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>