18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2452 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2452  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  294  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3947  hypothetical protein  89.31 
 
 
132 aa  237  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2178  hypothetical protein  82.91 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2224  hypothetical protein  82.91 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2167  hypothetical protein  82.91 
 
 
138 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00639311  hitchhiker  0.00146047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12723  transmembrane protein  70.25 
 
 
148 aa  163  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2239  hypothetical protein  65.28 
 
 
147 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24450  hypothetical protein  54.65 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.221864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1836  hypothetical protein  56.96 
 
 
118 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1497  hypothetical protein  58.02 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3559  hypothetical protein  46.51 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0646303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3779  hypothetical protein  42 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00650913  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1434  hypothetical protein  39.74 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1908  hypothetical protein  36.79 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1469  hypothetical protein  37.97 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1146  hypothetical protein  34.21 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0690732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4540  hypothetical protein  38.04 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304402  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2118  hypothetical protein  43.94 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0876037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>