28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0014 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  96.23 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0028  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.490827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 981 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0027  tRNA-OTHER  95 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0904  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0028  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0016  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0024  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00143112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>