More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0904 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0904  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0015  tRNA-Lys  92.96 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.905096  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0629  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0035  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0047  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2889  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2890  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000200194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2891  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000194238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2892  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000182855  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0453  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000219585  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>