26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1590 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1590  transposase  100 
 
 		 53 aa  106  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0577947  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  83.67 
 
 		 534 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  83.67 
 
 		 534 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  83.67 
 
 		 534 aa  89.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  54.72 
 
 		 531 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  54.72 
 
 		 531 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  44.44 
 
 		 545 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  45.45 
 
 		 536 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  40.91 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  40.91 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  43.18 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  40.91 
 
 		 507 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  40.91 
 
 		 539 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  43.18 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  42.55 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  42.55 
 
 		 534 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  43.18 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  40.91 
 
 		 537 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>