59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1106 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 366 aa  731    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  40 
 
 		 273 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.4 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  24.46 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  31.82 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3381  hypothetical protein  23.94 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  hitchhiker  0.00468536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.78 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.18 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  21.79 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.29 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.12 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  25.75 
 
 		 735 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.66 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.08 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  20.49 
 
 		 519 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.87 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  24.46 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 		 241 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.13 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  24.6 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.67 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1670  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.71 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  29.05 
 
 		 649 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.26 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1604  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.71 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.87 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.87 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  24.07 
 
 		 474 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0795  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.81 
 
 		 927 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.337391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  25.68 
 
 		 630 aa  46.6  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  25 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.97 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.42 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  27.51 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2278  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.76 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.800011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.57 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.92 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 248 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.55 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  23.97 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  29.03 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.79 
 
 		 227 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.31 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.83 
 
 		 611 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.89 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  29.55 
 
 		 216 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.34 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54791  biogenesis protein  23.32 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  27.17 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0629  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.21 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162962  hitchhiker  0.0053075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.72 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  29.84 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  27.96 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  23.08 
 
 		 570 aa  42.7  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  25.11 
 
 		 586 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.17 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  25.11 
 
 		 586 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  27.43 
 
 		 608 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>