12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1322 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  756    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  48.44 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  34.04 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  32.01 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  31.45 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  28.49 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  28.7 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  24.45 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  33.06 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  28.43 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 		 523 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  29.63 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>