31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0154 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  46.56 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  46.48 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  45.77 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  47.89 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  50.7 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  53.52 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  53.52 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  45.07 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  51.41 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  51.59 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  53.97 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  50.79 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  50.79 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  46.96 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  45.07 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  52.27 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  36.94 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  35.77 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  41.51 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  43.21 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  39.84 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  38.3 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  30.56 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  32.29 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  50 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  39.44 
 
 		 466 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>