28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0029 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  85.56 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t30  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 124 bp  54  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  92.31 
 
 		 122 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  84.09 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0003  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.844027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0011  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>