20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0013 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0013  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619108  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 126 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>