16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1080 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1080  glutamine amidotransferase-like protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2471  conserved hypothetical protein  47.83 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  29.75 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0846  hypothetical protein  29.05 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  30.61 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0989  conserved hypothetical protein  34.4 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0187  glutamine amidotransferase-like protein  27.88 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000164935  normal  0.0532768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0994  hypothetical protein  27.62 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.811741  normal  0.0118978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1016  glutamine amidotransferase-like protein  28.91 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.42516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1482  hypothetical protein  28.49 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  29.75 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  29.82 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  30.41 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1174  glutamine amidotransferase, class II  32.39 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.640614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  24.88 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  29.57 
 
 
266 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>