More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0648 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0648  inorganic pyrophosphatase  100 
 
 
171 aa  341  4e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.357971  normal  0.0915916 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0198  Inorganic diphosphatase  74.27 
 
 
172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.565593  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0136  inorganic diphosphatase  57.74 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0742  inorganic diphosphatase  58.79 
 
 
176 aa  204  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0931  inorganic pyrophosphatase  58.24 
 
 
175 aa  203  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0015  inorganic diphosphatase  54.44 
 
 
185 aa  202  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4029  inorganic pyrophosphatase  59.28 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0165  Inorganic diphosphatase  56.02 
 
 
173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3708  inorganic pyrophosphatase  58.68 
 
 
178 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539271  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0652  inorganic pyrophosphatase  53.5 
 
 
173 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.854002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0492  inorganic pyrophosphatase  53.5 
 
 
173 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2974  inorganic pyrophosphatase  57.32 
 
 
199 aa  190  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0140  inorganic diphosphatase  56.1 
 
 
177 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1376  inorganic diphosphatase  54.49 
 
 
176 aa  187  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1198  inorganic pyrophosphatase  55.97 
 
 
172 aa  186  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1993  inorganic pyrophosphatase  57.32 
 
 
176 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1919  inorganic pyrophosphatase  57.32 
 
 
176 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0988  inorganic pyrophosphatase  57.32 
 
 
176 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0294  inorganic diphosphatase  56.6 
 
 
172 aa  185  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4154  inorganic pyrophosphatase  55.09 
 
 
177 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1272  Inorganic diphosphatase  53.89 
 
 
176 aa  184  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3002  inorganic diphosphatase  51.19 
 
 
178 aa  183  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0303  inorganic diphosphatase  50.9 
 
 
175 aa  183  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.710339  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2036  inorganic pyrophosphatase  55.15 
 
 
181 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.145918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0112  inorganic pyrophosphatase  48.26 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0484  inorganic pyrophosphatase  54.88 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0961372  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2350  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
179 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.570326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2076  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
179 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.450342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0040  inorganic pyrophosphatase  54.55 
 
 
181 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4779  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659439  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4683  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4813  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4834  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108749  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4694  inorganic pyrophosphatase  51.16 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3230  inorganic pyrophosphatase  54.88 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04095  inorganic pyrophosphatase  52.6 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3767  Inorganic diphosphatase  52.02 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04059  hypothetical protein  52.6 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0955766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4704  inorganic pyrophosphatase  52.02 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3784  inorganic pyrophosphatase  52.6 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5743  inorganic pyrophosphatase  52.02 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4479  inorganic pyrophosphatase  52.02 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4858  inorganic pyrophosphatase  52.02 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4795  inorganic pyrophosphatase  52.6 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3224  inorganic diphosphatase  51.2 
 
 
176 aa  180  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00598645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4879  inorganic diphosphatase  52.76 
 
 
175 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0696  inorganic pyrophosphatase  54.88 
 
 
178 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2903  inorganic pyrophosphatase  53.05 
 
 
177 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286706  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1164  Inorganic diphosphatase  50.9 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.289996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00215  inorganic pyrophosphatase  50.9 
 
 
176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0268  inorganic pyrophosphatase  53.05 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0685  inorganic diphosphatase  50.6 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0411  inorganic pyrophosphatase  50.58 
 
 
176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0106  inorganic pyrophosphatase  54.27 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3653  inorganic pyrophosphatase  55.49 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195267  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2664  inorganic pyrophosphatase  53.66 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00365311  normal  0.143617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3439  inorganic diphosphatase  51.2 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0879166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2565  inorganic pyrophosphatase  49.71 
 
 
175 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0610  inorganic pyrophosphatase  53.66 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2890  inorganic pyrophosphatase  48.24 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153551  hitchhiker  0.00329766 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0470  inorganic diphosphatase  54.72 
 
 
212 aa  177  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0790393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0625  Inorganic diphosphatase  53.53 
 
 
173 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1372  inorganic pyrophosphatase  51.83 
 
 
178 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0415  inorganic pyrophosphatase  52.69 
 
 
178 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1306  inorganic pyrophosphatase  51.83 
 
 
178 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2488  inorganic pyrophosphatase  47.59 
 
 
174 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2496  inorganic pyrophosphatase  54.88 
 
 
180 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81481  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3622  inorganic pyrophosphatase  51.5 
 
 
175 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4615  inorganic pyrophosphatase  51.81 
 
 
181 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1481  inorganic diphosphatase  51.81 
 
 
181 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336717  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3965  inorganic pyrophosphatase  51.5 
 
 
175 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3767  inorganic pyrophosphatase  51.5 
 
 
175 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0825  Inorganic diphosphatase  51.79 
 
 
176 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.445819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1978  inorganic diphosphatase  54.72 
 
 
172 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2160  inorganic pyrophosphatase  49.12 
 
 
175 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  0.987317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2358  Inorganic diphosphatase  49.41 
 
 
175 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2093  inorganic diphosphatase  47.13 
 
 
182 aa  175  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0606  inorganic diphosphatase  50.9 
 
 
175 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.943403  hitchhiker  0.00000000378375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1292  Inorganic diphosphatase  47.95 
 
 
175 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0329  inorganic pyrophosphatase  54.27 
 
 
177 aa  174  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1025  Inorganic diphosphatase  50.61 
 
 
179 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2349  inorganic pyrophosphatase  48.54 
 
 
175 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3364  inorganic diphosphatase  50.87 
 
 
178 aa  173  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0647  inorganic pyrophosphatase  52.2 
 
 
172 aa  173  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1513  inorganic pyrophosphatase  50.29 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000365711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0728  Inorganic diphosphatase  51.48 
 
 
179 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2123  inorganic pyrophosphatase  50 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3057  inorganic diphosphatase  47.31 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1074  inorganic pyrophosphatase  50.3 
 
 
175 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11690  inorganic pyrophosphatase  50.3 
 
 
175 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0598  inorganic pyrophosphatase  49.7 
 
 
177 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00625335  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07940  inorganic pyrophosphatase  49.7 
 
 
175 aa  171  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2669  inorganic diphosphatase  49.71 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  normal  0.133967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001690  inorganic pyrophosphatase  50.3 
 
 
176 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0583  inorganic diphosphatase  51.22 
 
 
177 aa  170  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.297464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1758  inorganic diphosphatase  49.71 
 
 
186 aa  170  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0722  inorganic pyrophosphatase  50.31 
 
 
175 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1964  Inorganic diphosphatase  49.71 
 
 
176 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0462  inorganic pyrophosphatase  50.58 
 
 
176 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.807275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3829  inorganic pyrophosphatase  49.7 
 
 
175 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>