22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6117 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  100 
 
 		 439 aa  847    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  31.87 
 
 		 422 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  33.01 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  27.6 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 486 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  25.85 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  27.21 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  32.13 
 
 		 312 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  26.75 
 
 		 666 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24.94 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  24.71 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  25 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  23.34 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  23.34 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>