26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5730 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5087  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2499  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  30.09 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3612  putative prophage repressor  30.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.6 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  36.72 
 
 		 351 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0210  putative prophage repressor  29.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  29.49 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2421  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1311  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.62 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1064  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2632  hypothetical protein  27.87 
 
 		 126 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 60 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 371 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 136 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  31.06 
 
 		 825 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 335 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  42.11 
 
 		 377 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34 
 
 		 508 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 124 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 109 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 117 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>