58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5542 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5542  BLUF domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283955  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0888  BLUF domain protein  70.97 
 
 
155 aa  234  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0990729  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  69.03 
 
 
155 aa  233  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  69.03 
 
 
155 aa  233  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  65.16 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  60 
 
 
155 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  28.67 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  28.67 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  28.97 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  26.76 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  36.67 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  30.43 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  33.33 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  30.77 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  27.73 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  33.7 
 
 
296 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  34.44 
 
 
140 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  35.16 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  34.07 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  32.61 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  32.97 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  32.22 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  26.06 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  29.67 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  28 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  34.44 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  28.89 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  33.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  34.69 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  31.52 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  31.11 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  31.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  30.43 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  27.47 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  25.2 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  27.66 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  31.11 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  33.72 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  32.61 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  27.78 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  26.67 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  30.43 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  26.37 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  25.74 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  25.71 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 
373 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
378 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  31.65 
 
 
135 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  32.05 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  30.43 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  31.11 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  27.66 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  28.4 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  28.42 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>