25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4806 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  100 
 
 		 371 aa  748    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  54.49 
 
 		 339 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  49.26 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  50 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  50 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  51.62 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.81 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  31.99 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  34.18 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  28.66 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  28.98 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  29.22 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  29.04 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  31.02 
 
 		 286 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  29.63 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  29.22 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  28.63 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  24.91 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  24.91 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  24.53 
 
 		 284 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  24.6 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  22.81 
 
 		 261 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  24.33 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  22.99 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>