42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2817 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  77.02 
 
 		 513 aa  720    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  84.06 
 
 		 508 aa  829    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  84.68 
 
 		 508 aa  842    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  79.4 
 
 		 516 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 509 aa  1022    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  73.89 
 
 		 528 aa  720    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  84.65 
 
 		 508 aa  835    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  73.83 
 
 		 534 aa  723    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  77.23 
 
 		 512 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  73.02 
 
 		 500 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  73.88 
 
 		 502 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  74.09 
 
 		 502 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  76.33 
 
 		 468 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  73.98 
 
 		 533 aa  722    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  75.26 
 
 		 540 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  74.43 
 
 		 535 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  72.44 
 
 		 521 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  74.25 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  39.2 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  37.53 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  37.38 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  37.89 
 
 		 418 aa  279  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  38.11 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  37.38 
 
 		 412 aa  276  8e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  36.5 
 
 		 422 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  40 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  35.19 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  38.73 
 
 		 422 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.5 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30 
 
 		 422 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.89 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.29 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  28.43 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.46 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.24 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5361  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  28.57 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.752323  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.34 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.44 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.12 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.44 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.61 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.5 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>