More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2259 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2259  carbonic anhydrase  100 
 
 
339 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.288291  normal  0.676633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  72.49 
 
 
340 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  71.89 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1506  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  70.62 
 
 
340 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0741  carbonic anhydrase  58.72 
 
 
343 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1749  carbonic anhydrase  57.27 
 
 
356 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0545  carbonic anhydrase  46.27 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  hitchhiker  0.00175013 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3659  carbonic anhydrase  43.16 
 
 
347 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0725502  normal  0.181373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5022  carbonic anhydrase  42.39 
 
 
348 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.585067  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  37.36 
 
 
182 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  36.08 
 
 
172 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  32.75 
 
 
182 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  32.37 
 
 
182 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  31.45 
 
 
171 aa  102  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  32.75 
 
 
182 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  33.13 
 
 
182 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  35.93 
 
 
171 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0072  transferase  37.28 
 
 
187 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  36.08 
 
 
170 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  37.43 
 
 
184 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  32.53 
 
 
182 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  33.13 
 
 
182 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  32.16 
 
 
182 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  32.16 
 
 
182 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  31.79 
 
 
182 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  32.75 
 
 
185 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  33.13 
 
 
181 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  32.5 
 
 
174 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.33 
 
 
185 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  37.04 
 
 
175 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  31.33 
 
 
182 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  37.04 
 
 
175 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  32.53 
 
 
184 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  31.55 
 
 
182 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  36.42 
 
 
175 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  33.74 
 
 
185 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  31.55 
 
 
182 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  34.55 
 
 
179 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  38.55 
 
 
172 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  32.53 
 
 
184 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  31.9 
 
 
183 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  34.1 
 
 
185 aa  96.3  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  31.95 
 
 
180 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  31.76 
 
 
182 aa  95.9  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  35.8 
 
 
176 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  34.94 
 
 
180 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  32.32 
 
 
180 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  37.11 
 
 
169 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
184 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  35.26 
 
 
170 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  32.12 
 
 
182 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  31.33 
 
 
178 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  36.13 
 
 
182 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  32.12 
 
 
174 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  31.33 
 
 
179 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  30.59 
 
 
192 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  35.54 
 
 
172 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  35.54 
 
 
172 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  37.5 
 
 
175 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  30.77 
 
 
179 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  29.52 
 
 
177 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  33.13 
 
 
177 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  31.68 
 
 
170 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  31.68 
 
 
170 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  31.68 
 
 
170 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  31.68 
 
 
170 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  32.53 
 
 
177 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  31.06 
 
 
180 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  31.79 
 
 
183 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  31.33 
 
 
180 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  34.34 
 
 
172 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  30.43 
 
 
170 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  36.21 
 
 
187 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  29.45 
 
 
184 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  31.06 
 
 
170 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  31.01 
 
 
180 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  35.26 
 
 
173 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  30.86 
 
 
170 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  30.43 
 
 
170 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  30.72 
 
 
178 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  31.98 
 
 
177 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  35.12 
 
 
189 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  30.43 
 
 
170 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  30.95 
 
 
179 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  31.25 
 
 
170 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  35.54 
 
 
177 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.68 
 
 
180 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  34.09 
 
 
189 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  32.91 
 
 
174 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  30.3 
 
 
181 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.41 
 
 
169 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1498  carbonic anhydrase  35.85 
 
 
180 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.78 
 
 
174 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  29.7 
 
 
169 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  30.67 
 
 
184 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  30.72 
 
 
180 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  30.67 
 
 
184 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>