32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1161 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  836    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  40.61 
 
 
464 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  38.53 
 
 
556 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  47.78 
 
 
1953 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  34.78 
 
 
540 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2706  putative competence-specific nuclease  32.98 
 
 
144 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0962357  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0003  nuclease  31.19 
 
 
144 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.322302  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3914  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4023  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3746  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3762  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.867511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4220  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1129  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.757124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4110  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4055  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4129  competence-specific nuclease  30.77 
 
 
144 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.559938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  33.64 
 
 
153 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  35.78 
 
 
118 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3833  putative competence-specific nuclease  32.22 
 
 
144 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.29 
 
 
1421 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  36.27 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  27.43 
 
 
129 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  31.73 
 
 
119 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  34.75 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>