18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0148 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  100 
 
 		 115 aa  214  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  44.83 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  39.45 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  38.18 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  37.8 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  47.76 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4599  putative iron uptake protein  46.38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  41.67 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4118  putative iron uptake protein  47.83 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.74371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1369  hypothetical protein  53.57 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600356  normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4486  putative iron uptake protein  47.76 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  28.4 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  32.32 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0271  hypothetical protein  41.1 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  34.57 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  29.67 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2053  hypothetical protein  35.44 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>