More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5162 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  100 
 
 		 843 aa  1666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  80.09 
 
 		 856 aa  1322    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  80.09 
 
 		 856 aa  1307    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2581  condensation domain-containing protein  34.3 
 
 		 935 aa  263  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  35.82 
 
 		 1375 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.16 
 
 		 9498 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1246  condensation domain protein  37.38 
 
 		 938 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.75 
 
 		 6661 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0847  condensation domain-containing protein  32.43 
 
 		 940 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.369359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.92 
 
 		 3498 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.85 
 
 		 2054 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.54 
 
 		 2448 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 		 6403 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.91 
 
 		 2867 aa  231  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  23 
 
 		 1449 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 		 2395 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  35.33 
 
 		 2201 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 		 2395 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 		 3231 aa  227  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.89 
 
 		 3432 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  37.75 
 
 		 1109 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  36.39 
 
 		 3942 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.7 
 
 		 1876 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 		 2664 aa  221  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 		 3824 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.33 
 
 		 2156 aa  219  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.94 
 
 		 2125 aa  218  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.79 
 
 		 3308 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.69 
 
 		 2156 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.97 
 
 		 4332 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  34.58 
 
 		 1356 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  32.37 
 
 		 2752 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.91 
 
 		 4336 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.73 
 
 		 4336 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.94 
 
 		 2189 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.96 
 
 		 4318 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.09 
 
 		 5213 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.06 
 
 		 4317 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.28 
 
 		 4960 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.22 
 
 		 2156 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.08 
 
 		 1556 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  35.32 
 
 		 2333 aa  214  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  35.08 
 
 		 1369 aa  213  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  36.28 
 
 		 2626 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  37.44 
 
 		 2137 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 		 1870 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.34 
 
 		 4747 aa  213  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.79 
 
 		 4342 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 		 1870 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.82 
 
 		 4317 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 		 5738 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.27 
 
 		 7712 aa  212  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.99 
 
 		 4968 aa  212  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.33 
 
 		 4342 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.99 
 
 		 1138 aa  211  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.81 
 
 		 4960 aa  210  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.78 
 
 		 2151 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.88 
 
 		 1556 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.75 
 
 		 3639 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.12 
 
 		 2033 aa  210  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 1436 aa  210  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.4 
 
 		 4037 aa  210  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  34.82 
 
 		 3331 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.4 
 
 		 2193 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  29.86 
 
 		 2006 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 		 1119 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.07 
 
 		 2370 aa  207  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 		 1193 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  30.3 
 
 		 1193 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.11 
 
 		 4317 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.78 
 
 		 4136 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  33.57 
 
 		 5654 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.11 
 
 		 4317 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.54 
 
 		 5149 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.49 
 
 		 6889 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.5 
 
 		 2883 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 2098 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.17 
 
 		 4502 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.13 
 
 		 2628 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.66 
 
 		 4383 aa  204  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  30.07 
 
 		 1578 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.84 
 
 		 5230 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.54 
 
 		 7168 aa  203  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 2419 aa  203  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.65 
 
 		 1829 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  34.14 
 
 		 2878 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 1550 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 		 5328 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  35.27 
 
 		 1104 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.83 
 
 		 3291 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  30.31 
 
 		 1146 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.71 
 
 		 5953 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  37.12 
 
 		 3018 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 		 5596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  30.72 
 
 		 1363 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  35.95 
 
 		 2350 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 		 2581 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2107  condensation domain-containing protein  33.11 
 
 		 504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  34.78 
 
 		 1104 aa  200  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 		 2571 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>