19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3233 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  100 
 
 		 526 aa  1077    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  32.54 
 
 		 515 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  33.76 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  30.81 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  35.67 
 
 		 342 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  27.78 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  27.78 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 400 aa  100  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  26.72 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 502 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.49 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  27.91 
 
 		 337 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  29.62 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  26.24 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  24.53 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1086  hypothetical protein  31.2 
 
 		 184 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  26.39 
 
 		 579 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>