12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3102 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  85.22 
 
 		 913 aa  1399    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  79.1 
 
 		 910 aa  1483    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 914 aa  1862    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  77.67 
 
 		 911 aa  1464    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  25.14 
 
 		 834 aa  109  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.37 
 
 		 1068 aa  91.3  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  24.7 
 
 		 814 aa  87.8  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.24 
 
 		 1068 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  25.44 
 
 		 941 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.54 
 
 		 1122 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  24.2 
 
 		 959 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  24.1 
 
 		 945 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>