26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1460 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  100 
 
 		 371 aa  711    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  63.58 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  56.16 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  47.69 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  26.09 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  26.39 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  26.93 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  23.01 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  24.16 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  25.43 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.13 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.13 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  23.81 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  25.32 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  21.99 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 354 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.45 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  26.21 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  26.38 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  22.74 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  27.03 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.15 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  28.47 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  20.17 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>