15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0047 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.363749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0068  tRNA-Ser  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.802658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0002  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.302196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0026  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 85 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141177  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0026  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0150471  normal  0.143163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0053  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0024  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 84 bp  89.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1252  hitchhiker  0.00000142031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0020  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0019  tRNA-Ser  89.33 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0238116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.814887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0075  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  83.54 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>