31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0008 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0007    100 
 
 		 203 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0052  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.707391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    96.15 
 
 		 371 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    96.15 
 
 		 384 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0013  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0536074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>