19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0829 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
411 aa  848    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  62.29 
 
 
418 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  28.28 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  26.88 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  25.87 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  23.57 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  26.65 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  30.2 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  27.57 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  23.17 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  20.87 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.07 
 
 
745 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  24.19 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  28.05 
 
 
367 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.58 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  20.6 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  20.6 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  20.6 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  20.33 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>