18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0773 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0773  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  hitchhiker  0.00671435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1049  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  27.27 
 
 
332 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3373  hypothetical protein  29.66 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_39  hypothetical protein  27.78 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000854839  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0037  hypothetical protein  27.82 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448111  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0040  hypothetical protein  26.4 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2146  hypothetical protein  24.44 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  25.19 
 
 
346 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  23.7 
 
 
340 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0386  putative PAS/PAC sensor protein  23.08 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2121  hypothetical protein  23.7 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  22.96 
 
 
340 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  22.96 
 
 
340 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  23.36 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  23.7 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03879  hypothetical protein  23.2 
 
 
143 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1052  diguanylate cyclase  25.19 
 
 
346 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>