29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0545 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  68.78 
 
 
189 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  62.83 
 
 
195 aa  257  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  66.31 
 
 
191 aa  248  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  49.48 
 
 
194 aa  193  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  53.85 
 
 
202 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  50.51 
 
 
211 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  46.81 
 
 
196 aa  157  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  45.64 
 
 
199 aa  140  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  36.73 
 
 
198 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  35.47 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1107  hypothetical protein  40.82 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  37.24 
 
 
198 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  36.92 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  38.27 
 
 
199 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  38.28 
 
 
207 aa  108  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2697  protein of unknown function DUF358  36.73 
 
 
199 aa  104  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000860  hypothetical protein  27.14 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000138514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06835  hypothetical protein  26.63 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0182  hypothetical protein  26.87 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1778  hypothetical protein  25.76 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.459954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1812  hypothetical protein  26.4 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00771142  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2654  hypothetical protein  26.4 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2539  hypothetical protein  26.4 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2532  hypothetical protein  26.4 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0460  hypothetical protein  32.79 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0549  hypothetical protein  25.77 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>