More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0089 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  96 
 
 		 80 bp  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  95.89 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna063  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna073  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000472118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna069  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0028  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna116  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  0.0000036975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0077  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0020  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00108  tRNA-Met  93.15 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>