19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8508 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8508    100 
 
 		 315 bp  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174411  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  82.18 
 
 		 633 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  89.36 
 
 		 615 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  89.36 
 
 		 615 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  89.36 
 
 		 615 bp  54  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  90.7 
 
 		 615 bp  54  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  90.24 
 
 		 402 bp  50.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6343    96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00153722  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  96.55 
 
 		 594 bp  50.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  96.55 
 
 		 576 bp  50.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  96.55 
 
 		 579 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  96.55 
 
 		 594 bp  50.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  96.55 
 
 		 594 bp  50.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  88.64 
 
 		 531 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  93.75 
 
 		 594 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 660 bp  46.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1102    100 
 
 		 6388 bp  46.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 660 bp  46.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 660 bp  46.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>