More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7471 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  81.75 
 
 
394 aa  670    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7471  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.818426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0739  thiolase  77.18 
 
 
395 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4419  acetyl-CoA acetyltransferase  76.15 
 
 
395 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1953  acetyl-CoA acetyltransferase  74.87 
 
 
395 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0102019  normal  0.550682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4497  acetyl-CoA acetyltransferase  76.67 
 
 
394 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509306  normal  0.249354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4738  thiolase  72.56 
 
 
394 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  70.26 
 
 
394 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  65.37 
 
 
394 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.45 
 
 
392 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  52.58 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
393 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
392 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
402 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
392 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
394 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
394 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  52.31 
 
 
392 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  54.76 
 
 
395 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 
395 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
394 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
396 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
391 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
394 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
393 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
394 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
393 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
392 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
393 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 
393 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  47.29 
 
 
392 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
393 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
393 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
392 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  51.28 
 
 
394 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
395 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
393 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
390 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 
391 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 
394 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
396 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  50.26 
 
 
394 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 
394 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
392 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
392 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 
394 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
392 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
396 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
392 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  50.51 
 
 
394 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>