17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7012 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  97.5 
 
 
160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  70.99 
 
 
158 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  35.03 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  41.51 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  31.2 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  32.08 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  33.6 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  31.75 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  31.78 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  38.46 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  26.14 
 
 
222 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  30.47 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0281  hypothetical protein  27.15 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1364  hypothetical protein  23.68 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>