21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5638 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 114 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  63.16 
 
 		 111 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3720  protein of unknown function DUF1236  46.96 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  35.34 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  34.48 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  33 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  34.07 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4213  hypothetical protein  35.87 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  32 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5624  hypothetical protein  32.67 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  32.17 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  32.2 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  30 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  29.67 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  29.67 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  38.89 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  30.26 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  31.58 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  30.26 
 
 		 266 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  34.21 
 
 		 105 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>