39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5460 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5460  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 365 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  64.51 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.7 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3778  hypothetical protein  30.91 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2350  hypothetical protein  32.02 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0908976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3856  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.12 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.65 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  32.07 
 
 		 509 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.08 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2182  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.13 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.82 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  28.65 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2006  hypothetical protein  21.8 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3267  hypothetical protein  28.04 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.46 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.22 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  21.54 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.91 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.52 
 
 		 595 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.71 
 
 		 493 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.41 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  24.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.04 
 
 		 844 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.53 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 3301 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2837  hypothetical protein  25.54 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  29.41 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.4 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.35 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.56 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 505 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  29.41 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  28.16 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0398  hypothetical protein  25.53 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 		 979 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  31.16 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.05 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>