13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4083 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  91.18 
 
 		 276 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  92.24 
 
 		 116 aa  190  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1606  HNH endonuclease  66.98 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.982514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0765  HNH endonuclease  58.56 
 
 		 111 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  48.7 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  40.22 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1896  hypothetical protein  46 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  37.04 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  36.62 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 81 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>