167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0932 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0932  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  48.45 
 
 
362 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  55.41 
 
 
366 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  50.54 
 
 
356 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  43.75 
 
 
374 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  55.56 
 
 
367 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  55.56 
 
 
367 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  55 
 
 
362 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  46.39 
 
 
362 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  46.39 
 
 
362 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  46.39 
 
 
362 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  46.39 
 
 
362 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  49.46 
 
 
363 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  55.7 
 
 
626 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  50 
 
 
365 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  51.25 
 
 
366 aa  88.2  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  55 
 
 
361 aa  88.2  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  55 
 
 
361 aa  88.2  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  54.76 
 
 
379 aa  87.8  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  46.94 
 
 
359 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  48.81 
 
 
362 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  48.81 
 
 
362 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  48.81 
 
 
362 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  51.28 
 
 
359 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  43.52 
 
 
389 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  43.52 
 
 
362 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  43.52 
 
 
362 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  43.52 
 
 
362 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  51.39 
 
 
370 aa  84.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  48.81 
 
 
364 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  50 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  48.72 
 
 
364 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  50.63 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  41.3 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  45.68 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  49.37 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  49.37 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  49.37 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  47.5 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  41.67 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  56.72 
 
 
373 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  49.25 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  46.25 
 
 
363 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  54.55 
 
 
355 aa  78.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  45.68 
 
 
366 aa  78.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  46.25 
 
 
363 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  41.67 
 
 
360 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4694  hypothetical protein  46.24 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  44.3 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  45.78 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  45.78 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  45.78 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  50 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  44.58 
 
 
363 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  44.58 
 
 
363 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  41.46 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  43.37 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>